透明细胞癌的真正起因仍不能确定，认为能够引起透明细胞癌的有：放射线，包括太阳光，游离性辐射品，如铀、镭、紫外光线。可引起皮肤癌、骨癌和血液方面
阴道透明细胞癌
的癌症。 化学物质
空气污染与吸烟
：产生碳氧化合物，易刺激呼吸道，引起肺透明细胞癌。饮食的不当：如嗜吃酸辣食物或腌浸蔬菜，易得胃透明细胞癌，而一些食品添加剂和着色剂，也可能导致透明细胞癌。高脂肪食物可能与大肠透明细胞癌、乳腺透明细胞癌有关。
食物贮藏方式
：一些发霉食物如酱类或干湿物上长有真菌，进而产生霉素，可能引起透明细胞癌。尤其是黄曲霉素，已被证实与肝透明细胞癌关系密切。
某些药物
，例如荷尔蒙，也被怀疑与乳透明细胞癌、子宫透明细胞癌有关。
个人习惯
1、吸烟者比不吸烟者易患肺透明细胞癌20倍，口腔癌3-10倍，喉癌3-17倍。
2、性生活的多少与妇女子宫透明细胞癌有关。
滤过性病毒与寄生虫
。一部分血液及淋巴癌症与病毒有关。软部肿瘤、子宫颈癌、鼻咽癌亦然。
