多有反复性或持续性进行性肺部感染。
肺隔离症术后并发症除具有肺叶切除术的共同并发症外，尚有
（1）大出血：其原因主要是因缝扎不紧、缝线脱落致血管出血。由于主动脉压力高，畸形血管残端部分的出血往往量多且猛，该并发症常发生于术后48小时内，表现为脉搏细速、心率加快、血压下降等失血性休克征象，胸腔引流量骤增，表明胸腔内有较明显的出血。一旦发生此种出血，常需立即再次进胸止血。
（2）食管胸腔瘘：此类情况较少见，但一旦发生则预后较差。其原因之一是手术损伤食管，之二是潜在支气管食管瘘术中未发现，残端未处理，一旦出现，宜充分引流，必要时再次开胸处理。
（3）婴幼儿特别是新生儿并非手术禁忌，但此类患儿常伴有其他畸形及肺发育不良，术后易发生水、电解质、酸碱平衡失调及肺部和全身感染，术后早期宜使用一段时间呼吸机，后期要多拍背，必要时雾化吸入，以促进痰液排出。