随着胬肉逐步向角膜中心方向推进还可以引起角膜散光，一旦伸展至瞳孔区，则可严重妨碍视力，大的翼状胬肉可影响眼球的运动。侵犯角膜可以引起不同程度的角膜混浊，但极少出现角膜感染性炎症。更多的并发症在手术中发生，如感染、结膜上皮植入性囊肿、直肌损伤导致粘连、眼球穿破以及角膜变薄导致散光等，需要加以注意。