尼帕病毒感染患者出现深静脉血栓的治疗方法包括抗凝治疗、溶栓治疗、手术取栓、介入治疗、一般支持治疗等。

1. 抗凝治疗：是深静脉血栓治疗的基础，常用药物有肝素、低分子肝素、华法林、新型口服抗凝药如利伐沙班等。肝素和低分子肝素起效快，可迅速抑制血栓的进一步形成；华法林需监测国际标准化比值INR来调整剂量；新型口服抗凝药使用方便，无需常规监测凝血指标，但价格相对较高。

2. 溶栓治疗：分为系统性溶栓和导管接触性溶栓。系统性溶栓是通过静脉滴注溶栓药物如尿激酶、链激酶等，使血栓溶解，但出血风险相对较高。导管接触性溶栓是将溶栓导管置入血栓内，直接给药，可提高溶栓效果，减少出血并发症。

3. 手术取栓：对于病程较短、血栓形成时间不超过72小时、全身状况良好的患者，可考虑手术取栓。手术能迅速去除血栓，恢复静脉血流，但手术创伤较大，有一定的风险。

4. 介入治疗：包括经皮机械血栓清除术、下腔静脉滤器置入术等。经皮机械血栓清除术可快速清除血栓；下腔静脉滤器置入术可预防肺栓塞，但长期置入可能导致下腔静脉血栓形成等并发症。

5. 一般支持治疗：患者需卧床休息，抬高患肢，促进静脉回流，减轻肿胀和疼痛。同时，要密切观察生命体征、患肢的肿胀程度、皮肤温度等变化。

尼帕病毒感染患者出现深静脉血栓的治疗需综合考虑患者的具体情况，制定个体化的治疗方案。治疗过程中要密切监测病情变化，及时调整治疗措施。患者应严格遵循医生的治疗建议，积极配合治疗，治疗后要定期复查，以评估治疗效果和预防复发。