13岁男孩膝盖疼可能由多种原因引起，包括生长疼痛、运动损伤、关节炎等。以下是一些可能的原因：

1. 生长疼痛：在青春期，孩子的骨骼和肌肉会迅速生长，这可能导致关节和肌肉的疼痛。这种疼痛通常是暂时性的，可以通过休息和适当的运动来缓解。

2. 运动损伤：如果孩子经常参加剧烈运动或体育活动，可能会导致膝盖受伤。例如，扭伤、拉伤或骨折都可能导致膝盖疼痛。在这种情况下，建议及时就医并遵循医生的建议进行治疗。

3. 关节炎：虽然关节炎更常见于成年人，但儿童也可能患上这种疾病。关节炎可能导致关节肿胀、疼痛和僵硬。如果怀疑孩子可能患有关节炎，应尽快就医进行诊断和治疗。

4. 感染：膝盖疼痛可能是由于感染引起的，如滑膜炎或骨髓炎。这些疾病通常需要抗生素治疗。

5. 其他原因：还有一些其他原因可能导致膝盖疼痛，如肿瘤、囊肿等。这些情况较为罕见，但仍需要关注并及时就医。

总之，13岁男孩膝盖疼痛可能有多种原因。如果疼痛持续或加重，建议及时就医以确定具体原因并采取相应的治疗措施。同时，保持良好的生活习惯和适当的运动也有助于预防和缓解膝盖疼痛。