药流即药物流产，孕囊太小确实存在看不清排出物的可能性。

孕囊是原始的胎盘组织，被羊膜、血管网包裹的小胚胎。在药物流产过程中，药物如米非司酮和米索前列醇会促使子宫收缩，从而使孕囊从子宫壁上剥离并排出体外。然而，当孕囊体积较小时，其结构可能不够明显，容易与血块、蜕膜组织等混合在一起，使得肉眼难以直接分辨。特别是在药物流产过程中，出血和组织排出可能比较迅速，进一步增加了看清孕囊的难度。

此外，孕囊太小还可能导致药物流产的效果不佳。如果孕囊过小，药物可能无法充分作用于孕囊，使其无法完全剥离并排出体外，从而导致流产失败或不完全流产。因此，在进行药物流产前，医生通常会通过B超检查确认孕囊的大小和位置，以确保药物流产的安全性和有效性。

选择药物流产的女性，特别是孕囊较小的情况，应在流产后密切关注身体变化。如果出血持续不止或伴有剧烈腹痛等症状，应及时就医进行超声检查，以确定宫腔内是否还有残留组织。同时，女性在流产后应注意休息，避免剧烈运动和过度劳累，以免影响子宫恢复。此外，保持个人卫生和营养均衡也是促进身体恢复的重要因素。