月经十三天了还有褐色分泌物，与内分泌失调、子宫肌瘤、子宫内膜息肉等原因有关，需要立即明确原因，遵医嘱使用药物、手术等方法进行治疗。

1.内分泌失调：长期的精神压力、情绪波动可能影响下丘脑的功能，进而干扰卵巢的排卵功能和激素分泌，导致子宫内膜不能及时完全转化，从而出现经期延长，月经后期出现褐色分泌物。建议适当进行运动，比如快走、慢跑等，有助于调节内分泌。若症状严重，可以遵医嘱使用黄体酮胶囊、屈螺酮炔雌醇片等药物进行治疗。

2.子宫肌瘤：若子宫部位存在肌瘤，可能使子宫腔增大，不利于子宫收缩，继而出现月经量增多和经期延长等表现。另外，肌瘤可能会压迫子宫内膜的血管，使血管破裂后不易止血，造成月经淋漓不尽。轻症者可以遵医嘱使用宫瘤消胶囊、米非司酮片等药物治疗，若肌瘤较大可以考虑肌瘤切除术、子宫切除术等手术方法治疗。

3.子宫内膜息肉：子宫内膜出现息肉后，可能会影响子宫内膜的正常脱落，导致经期延长、经量增多。息肉的表面容易发生破溃、出血，而且由于其阻碍了子宫的正常收缩，出血后不易止住，使得月经后出现褐色分泌物。对此需进行全面检查，在宫腔镜下使用电切环将息肉从根部切除，术后需要将切除的息肉送病理检查，以排除恶变的可能。

如果遇到这种情况，建议及时就医，进行详细的妇科检查，以便找出具体原因并采取相应的治疗措施。同时，保持良好的生活习惯，避免过度劳累，保持心情舒畅，也有助于改善症状。