一般情况下，甲流可能会导致肩膀疼。甲流是由甲型流感病毒引起的急性呼吸道传染病，感染后病毒在体内引发免疫反应，免疫系统会释放炎性介质，如前列腺素等。这些炎性介质会使身体的痛觉感受器敏感性增加，导致全身肌肉酸痛，肩膀部位的肌肉也会受到影响，从而出现疼痛症状。

同时，甲流患者常伴有发热症状，体温升高会加快身体的新陈代谢，使肌肉组织中乳酸等代谢产物堆积。当乳酸在肩膀肌肉处积聚时，就会刺激神经末梢，产生酸痛感。另外，甲流期间身体较为虚弱，长时间保持一个姿势休息，或者因咳嗽等动作导致肩部肌肉频繁收缩，也可能引发或加重肩膀疼痛。

感染甲流期间需保证充足的睡眠和休息，让身体得到恢复。饮食上多摄入富含营养且易消化的食物，增强身体抵抗力。注意保暖，避免肩部受凉加重疼痛。若肩膀疼痛持续不缓解或伴有呼吸困难、胸痛等严重不适，应及时就医，遵专业建议进行治疗。