需要与下列疾病鉴别：
癫痫
面肌局限性抽搐亦可能是部分性运动性癫痫，但其抽搐幅度较大，并往往累及颈、上肢甚或偏侧肢体，或出现典型的按大脑皮质运动区顺序扩散的Jackson发作。脑电图上可见有癫痫波发放。仅仅局限于面部肌肉抽搐的癫痫罕见。
癔症性眼睑痉挛
常见于中年以上女性病人，多系两侧性，仅仅局限于眼睑肌的痉挛，而颜面下部的面肌则并不累及。
三叉神经痛
为面部阵发性短暂的剧烈疼痛，疼痛严重时可伴有面部肌肉抽搐。虽然原发性面肌抽搐发展至严重时，抽搐时间较久亦可引起面部疼痛，但其疼痛程度没有三叉神经痛那样剧烈。
舞蹈病及手足徐动症
可有面肌的不自主抽动，但均为两侧性的，且均伴有四肢类似的不自主运动。
无异常表现。
肌电图检查显示肌纤维震颤和肌束震颤波。特征是：①阵发高频率脉冲（每秒150～400个）；②每秒5～20次的节律性或不规则的重复发放，每次发放包括2～12个脉冲；③在所有的面肌中脉冲是同步的；④逆向性刺激面神经则引起典型发放。
