治疗目的是提供足够的食物和良好的环境以促进生长发育，营养饮食包括有足够热卡满足生长需要（每日提供超过正常同龄儿150%的热卡），患者还需要医疗帮助以及社会的支持。住院儿童不能根据体重增长情况区分是器质性FTT和非器质性FTT，因为如有足够营养，所有儿童均可生长。有些非器质性FTT患儿在医院内体重常减轻，提示即便父母照顾不足也比与父母分离好。
对有器质性FTT或混合性FTT患儿可能存在的疾病应尽快治疗。对有明显非器质性FTT或混合性FTT患儿，治疗包括提供教育和感情交流，纠正影响父母与小孩关系的问题，长期的社会支持和精神治疗也是必需的。
患儿出院前应制定出院治疗计划，医院的有关人员以及出院后的随访人员，家庭医生等应共同参加，最后建议以书面形式发给每个参与者。
对有些病例，患儿必须放在抚养中心。若孩子希望回到父母身边，须为父母提供喂养技能训练和心理咨询，了解父母的抚养能力和生活条件，而不是仅根据住院时间的长短出院。
