潜伏期6～14天。起病徐缓。
第一病周，逐渐出现不适，体温渐升，第3病日可达39℃，剧烈头痛、腰痛、肌肉关节痛、厌食、恶心、呕吐、上腹痛，部分患者眼眶疼痛，亦可有便秘或腹泻。体检见面、颈及上胸部潮红，上胸、上臂及腋窝皮肤可见瘀点、瘀斑，淋巴结中度肿大。结膜充血、眶周水肿、口咽黏膜充血、细小瘀点、软腭有大小不一的水疱，牙龈充血或出血。1/5病例于第4～6病日出现特殊的神经症状，表现为定向障碍、手和舌意向性震颤、中度共济失调、皮肤感觉过敏、腱反射和肌张力减退。女性患者常有轻度至中度的子宫出血，并可作为阿根廷出血热的首发症状。少数患者急性起病，似急腹症而致手术。第1周末随着发热的迅速消退而出现低血压、少尿和不同程度脱水，持续48小时后渐恢复。病重者可发生昏迷休克，少数在48～72小时死亡。血象检查显示白细胞和血小板减少，热退后渐恢复。可有蛋白尿及管型而血沉正常。
第2病周，70%～80%患者上述症状和体征减轻，但乏力、脱发及记忆力减退需经1～3个月恢复期，不留后遗症。20%～30%患者在8～12病日出现胃、肠、鼻、齿龈、子宫等严重出血或神经系统损害(意识障碍、共济失调、兴奋和震颤，甚至谵妄、抽搐、昏迷)，也可同时出现，导致死亡。