手术时如何完整地取出妊娠物，是预防持续性输卵管妊娠的关键。切口应在输卵管最突出的部分的中央，可避免漏取妊娠物，有人于切口旁注射生理盐水，将妊娠物整块冲出。也可于术前或术后应用甲氨蝶呤起到预防作用，或手术结束前胚胎着床局部甲氨蝶呤10～25mg。

预后：持续性输卵管妊娠者较一次异位妊娠后受孕机会更小，同时发生再次异位妊娠的可能性更大。前次输卵管妊娠行保守手术后，输卵管狭窄，通而不畅，可再次异位妊娠。药物治疗后也可因胚胎着床部位形成瘢痕或结节。输卵管通而不畅而发生再次异位妊娠;另外原来输卵管妊娠而行输卵管切除或行保守手术后不孕者，行胚胎移植体外受精或配子输卵管移植后，也可发生重复异位妊娠。