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原发性肝癌:肝多房棘球蚴病在非流行区常被误诊为肝癌,即使在手术探查时单作凭肉眼观察,也不易鉴别,原发性肝癌病程短,病情恶化快,血清甲胎蛋白试验阳性,肝多房棘球蚴病的诊断,流行病学史十分重要,包虫皮内试验简单易行,结合B超与CT扫描影像学特点,可资鉴别。
细粒棘球蚴病:在国内某些流行区如四川甘孜自治州,囊型与多房棘球蚴病混合存在,细粒棘球蚴病的症状为腹部无痛性肿块,而多房棘球蚴病患者大多有腹部隐痛,肝脏质硬,表面不平,有结节,B超与CT影像显著不同,易于区别。