本病应注意与良性交界瘤，幼年性黑色素及细胞性蓝痣相鉴别，亦更应注意与基底细胞癌相鉴别，还应注意与硬化性血管瘤，老年痣，脂溢性角化病，甲床下陈旧血肿相鉴别。
1.良性交界痣 镜下所见为良性大痣细胞，并无异性细胞，仅在真皮内生长，其炎性反应不明显。
2.幼年性黑色素瘤 于小孩面部呈生长缓慢的圆形结节，镜下见细胞呈多形性，有核分裂，瘤细胞不向表皮浸润，且瘤体表面亦不形成溃疡。
3.细胞性蓝痣 好发于臀，尾骶，腰部，呈淡蓝色结节，表面光滑而不规则，镜下可见树枝状突的深黑色细胞，大棱形细胞，并集合成细胞岛，有核分裂相或坏死区时，应考虑到有恶变的可能。
4.基底细胞癌 是上皮细胞的恶性肿瘤，由表皮的基底层向深部浸润，癌巢周围为一层柱状或立方形细胞，癌细胞染色深，无一定排列，癌细胞内可含黑色素。
5.硬化性血管瘤 表皮过度角化，真皮乳状增殖，扩张的毛细血管常被向下延伸的表皮突围绕，貌似表皮内血肿一样。
6.老年痣 见于老年人体表呈疣状的痣，表皮过度角化，粒层部分增厚或萎缩，棘层肥厚，基层完整，亦可有色素增加，真皮乳头增殖，外观呈乳头瘤样增生。
7.脂溢性角化病 病灶亦呈乳头瘤样增生，表皮下界限清楚，角化不完全，粒层先增厚，后变薄甚或消失，增生的表皮细胞内可有少量或较多的黑色素。
8.甲床下血肿 多有相应外伤史，镜下为干枯的血细胞，可有上皮成纤维细胞增生。
