常并发高血压、贫血、心力衰竭、心包炎、心肌病、水电紊乱及酸碱失衡、肾性骨病、骨折，感染等。除以上各系统并发症外，慢性肾功能衰竭长期透析者还可有如下并发症：
1.铝中毒 常规透析治疗的终末期肾病患者易并发铝中毒。导致慢性肾功能衰竭规律性血液透析患者铝中毒的原因很多，主要包括：透析液中含铝量过多。当透析液中铝含量接近50µg/L时，铝相关性骨病的发病率很高。因此，有作者建议透析液中铝含量至少应低于10µg/L，最好低于5µg/L。肾脏是排铝的唯一途径，慢性肾功能衰竭时吸收的铝在体内蓄积而致铝中毒。
2.透析相关性淀粉样变 透析相关性淀粉样变(DRA)是一种见于长期透析病人的骨关节病。其临床症状和发生率与透析时间的长短密切相关。透析5年时为0，12年时为50%，20 年时为100%。淀粉样物质在组织内的沉积大大早于临床症状和放射学表现出现之前。据一组前瞻性报道，血透时间短于2年者，关节淀粉样物质沉积率为 21%，7年者为50%，13年者为90%，超过13年者为100%。
3.微量元素变化 肾衰和透析对微量元素代谢的影响极大，它们聚积于身体各部位可引起毒性反应。
