1.胃镜检查：在内镜下可以直接观察到胆汁反流，胃黏膜表现为弥漫性充血，并伴有不同程度的黏膜皱襞水肿或糜烂。
胃镜检查是目前临床运用最为广泛的检查方式，不过，该方法需要精良的操作和严格的消毒，否则不但会对患者的胃部造成损伤，还可能交叉感染，引起多种疾病。
2.胃吸出物测定：通过从患者鼻腔插入胃管到达胃腔，继而抽吸空腹和餐后胃液，测定其中胆酸含量，如空腹基础胃酸分泌量<3.5mmol/h，胆酸超过30ug/ml，则可确诊胆汁返流性胃炎。
这种检查方法非常准确，但是检查过程会令患者感到非常不适。
3.同位素测定：通过静脉注射2mCi99mTc-丁亚胺双醋酸，观察肝、胆囊及胃部，决定肠胃返流指数。通过对胃内同位素含量的检测，可了解肠胃返流的程度。