1.营养不良
小胃综合征，进食后不适使病人长期处于半饥饿状态。倾倒综合征和胃肠道吸收不良使病人消瘦和营养不良。
2.贫血
由于术后胃酸减少，影响铁质的吸收，导致缺铁性贫血。由于胃切除后抗贫血因子缺乏，造成维生素B12吸收障碍，导致巨幼红细胞性贫血。
3.腹泻
多因毕Ⅱ式吻合后胃排空过快，小肠蠕动增强，消化与吸收不良所致。另外食物和胆汁、胰液不能很好地混合，丧失了胰液分解脂肪和胆盐的乳化脂肪作用，影响脂肪吸收，导致脂肪泻。
4.骨病
发生在术后5～10年后，以骨质软化为多见，严重者可致骨质疏松。主要症状有骨骼疼痛，下肢无力，容易骨折等。毕Ⅱ式术后食物不再经过十二指肠，钙吸收减少。脂肪吸收不良也影响脂溶性维生素D的吸收。