1.X线检查
(1)腹部平片：结肠闭锁患儿常发现多个伴有液气平面的扩张肠襻，在一段高度扩张的肠襻中出现一个较大的液气平面常是诊断横结肠闭锁的佐征。虽然小肠扩张一般不很明显，在X线平片上很难区分梗阻发生在小肠还是结肠。
(2)灌肠造影：对于区分结肠闭锁、先天性巨结肠、胎粪性肠梗阻及小肠闭锁具有重要意义。结肠闭锁时钡灌肠可见到幼稚结肠及结肠充盈不全，在Ⅰ型闭锁有时可发现“风袋征”，即造影剂将闭锁隔膜推向近端形成袋状。在结肠狭窄时可见造影剂从远端小而细的结肠通向近端扩张的结肠。有时很小的狭窄被胎粪堵塞，则呈现为结肠闭锁的表现。
2.纤维结肠镜或乙状结肠镜检查 可排除结肠其他病变引起的肠狭窄，并观察远端狭窄口情况，计算狭窄部与肛门间距离，为手术提供依据。