症状轻重与感染虫数寄生部位和持续时间有密切关系。异尖线虫幼虫可寄生于咽喉、胃和肠黏膜内，但胃受累为最常见，约为肠的2倍。日本报告胃异尖线虫病最多(97.3%)。潜伏期一般为2～20小时。据日本报告从吃生鱼片至发病的最短为30分钟，最长为168小时。 3～8小时内发病者占64%，12小时内发病者占88%。肠异尖线虫病潜伏期较长，一般在吃鱼片后1～5天发病。
临床症状与体征按幼虫侵入部位可分述如下：
1.胃异尖线虫病
可分为急性型和慢性型，前者是由于再感染而引起的Arthus型过敏性炎症;后者是为初次感染所致的局限性过敏反应幼虫寄生于胃体部和胃角部占85%以上。临床表现有上腹部疼痛或绞痛，反复发作常伴恶心、呕吐;少数有下腹痛。偶有腹泻。70%患者大便隐血阳性，外周血嗜酸性粒细胞明显增高。
2.肠异尖线虫病
男女之比约1.8∶1，10～39岁患者为主，病变部位有十二指肠空肠、回肠、盲肠、阑尾和直肠等。常在吃生鱼片后1～5天内突然剧烈腹痛、恶心、呕吐、腹胀、低热，继而出现腹泻、柏油样黏液便，右下腹和脐周等处有压痛有时可伴有荨麻疹等。患者常因肠穿孔、腹膜炎或局限性肠坏死而手术，在病变组织中发现本幼虫而确诊
3.食管异尖线虫病
吃生鱼片后感心窝部疼痛，午夜感胸骨下刺痛、嗳气，次晨就医，立即进行纤维内镜检查，在食管下段发现有白色虫体，用钳取出，鉴定为异尖属幼虫。
4.肠外异尖线虫病
本幼虫可穿透肠壁进入腹腔，再移行至肝、胰、大网膜、肠系膜、卵巢、腹壁皮下腹股沟或口腔黏膜等，引起腹膜炎嗜酸性肉芽肿和皮下包块。