胃癌三部曲的病菌是幽门螺杆菌。
原因如下：
1. 幽门螺杆菌感染是胃癌的重要危险因素之一。幽门螺杆菌感染可导致胃黏膜的慢性炎症，长期的炎症刺激会导致胃黏膜细胞的损伤和再生，增加了癌变的风险。
2. 幽门螺杆菌感染会导致胃酸分泌过多，胃酸的腐蚀作用会加剧胃黏膜的损伤和炎症，进一步增加了胃癌的风险。
3. 幽门螺杆菌感染还可导致胃黏膜的萎缩和肠化，这也是胃癌的前期病变之一。胃黏膜的萎缩和肠化会导致胃黏膜上皮细胞的异常增生和癌变。
因此，幽门螺杆菌感染是胃癌三部曲中的重要因素之一。预防和治疗幽门螺杆菌感染可以有效降低胃癌的发生率。