不同的患者病程可能有很大不同，但基本上表现为复发-缓解型、原发性持续进展型、继发性进展型和进展-复发型4种类型，患者也可最初表现为一种类型，以后又进展为另一种类型。一旦患病，即终身难愈，一般于患病10年左右即可出现完全的肢体瘫痪。

视力的预后主要取决于受累的眼组织和炎症的严重程度。视神经炎经过积极治疗后视力多能恢复，但对比敏感度的异常可长期存在;中间葡萄膜炎经过有效的糖皮质激素和(或)其他免疫抑制剂治疗后视力多能恢复至0.5以上。