1.发热性疾病 当急性尿路感染尿路症状不明显，但全身感染症状突出时，易与流感、疟疾、败血症、伤寒等发热性疾病相混淆。
2.腹部器官炎症 有些尿路感染无尿路局部症状，而表现为腹痛、恶心、呕吐等症状，易与急性胃肠炎、阑尾炎及附件炎相混淆。
3.急性尿道综合征 是一组最常见的与尿路感染有关的综合征，主要指下尿路感染综合征，即尿频、尿急、尿痛或排尿不适、膀胱区疼痛等。但既无脓尿也无细菌尿，其病因不明，多见于中老妇女，尿频常较排尿不适的表现更为突出，均有长期使用抗生素而无效的病史。
4.肾结核 有些尿路感染以血尿为主要表现，膀胱刺激征明显，易误诊为肾结核。需进行实验室检查相鉴别。