脂肪瘤生长缓慢，临床表现与肿瘤部位、大小、表面有无溃疡出血有关。肿瘤较小时患者可无任何临床症状，位于贲门附近者，可出现咽下困难;位于幽门区者可并发幽门梗阻症状。如肿瘤表面有溃疡可出现胃部不适、疼痛等类似胃溃疡或慢性胃炎的症状，约50%的病例可有出血。
胃脂肪瘤偶有恶变者。胃窦部脂肪瘤越靠近幽门，越易影响胃排空，患者可出现上腹饱胀不适、疼痛、间歇性呕吐等症状。当肿瘤体积增大到一定程度时，尤其是那些胃窦黏膜下的脂肪瘤，有时可以滑至幽门口甚至滑过幽门管进入十二指肠球部引起幽门梗阻，患者可出现呕吐隔夜食物等典型症状。这类病人左侧卧位时，腹胀、腹痛、呕吐症状可以减轻，出现类似胃黏膜脱垂的临床表现。无论是胃窦还是胃体部的脂肪瘤，当肿瘤直径大于4cm时，由于其凸入胃腔与食物摩擦，加之血供障碍，肿瘤表面黏膜可出现糜烂乃至溃疡形成，此时，患者多有腹痛及消化道出血，常为黑便，少有呕血。当患者有出血、梗阻和体重下降时，难以与恶性肿瘤鉴别。体格检查阳性体征较少，长期慢性失血患者可有贫血。上腹部可有压痛，幽门梗阻患者则震水音阳性，可见胃型及蠕动波。源于胃浆膜下的脂肪瘤患者，若肿瘤直径较大，体检时可在上腹部触及质地较软、活动、边界尚清的肿块。
