强直性脊柱炎肠道菌群无法彻底消灭，但可以控制其发展。原因如下：
1. 遗传因素：强直性脊柱炎有一定的遗传倾向，父母中有一方患病，其子女患病的风险较高。
2. 环境因素：环境因素也是导致强直性脊柱炎的重要原因之一，如肠道菌群紊乱、长时间处于湿冷环境、长时间使用抗生素、自身免疫异常等。
3. 自身免疫异常：强直性脊柱炎患者存在一些自身免疫异常，如肠道局部免疫系统紊乱、肠道内的菌群失衡等。
因此，强直性脊柱炎肠道菌群不能彻底消灭，但是可以通过控制饮食、加强锻炼、注意保暖等方式来改善肠道环境，增强免疫力，从而达到控制疾病发展的目的。