治疗由于洋地黄中毒，电解质紊乱引起的AF，首先应消除病因。
1.药物治疗 正常心脏新生儿或婴儿AF，1∶1房室传导，心室率极快，或持续发作，易致心肌病，发生心力衰竭，选用地高辛或奎尼丁维持量，以防复发。如房室传导为2∶1～3∶1，心室率在150次/min以下，患儿无明显症状，则无需用药，多数可望于1岁左右自行缓解。伴有心脏病或AF呈持续性的患者，应及时终止发作，除选用地高辛加奎尼丁外，尚可用普萘洛尔(心得安)，维拉帕米(异搏定)，普罗帕酮(心律平)，索他洛尔，胺碘酮等，但疗效较差。预激综合征并发AF禁用地高辛，有导致严重室性心律失常，发生心脏性猝死的危险。病态窦房结综合征并发AF用药物复律，可致心脏停搏，这点也需注意。
2.电击复律 同步直流电击复律效果好，用于新生儿、小婴儿无明显心脏病者更佳。接受地高辛治疗的病人，进行电击复律可引起严重室性心律失常，术前一天宜停服地高辛。如需紧急电击复律，应于术前静脉注射利多卡因1mg/kg，以预防发生室性心动过速。电能量1.0～2.0J/kg,，新生儿5～10J，最大量不超过20J，婴幼儿10～20J，最大量不超过50J，儿童20～50J，最大量不超过100J。每次治疗，电击不宜超过3次。复律后，用地高辛和(或)奎尼丁维持量6～12个月，以防复发。病态窦房结综合征患儿不宜电击复律。
3.心房起搏 右房内起搏或经食管心房起搏，以超速抑制法或短阵快速刺激(burst)终止AF。开始起搏周长为心房扑动周长的90%，随后每次重复起搏周长以10%递减，直至心律转复或出现心房不应期，每次起搏时间5～20s。如未转复，可延长起搏时间再重复。经食管心房起搏设备简单，安全易行，除起搏期间患者诉前胸烧灼感外，无不良反应，据报道成功率达73%。
4.射频消融术 可用于难治病例。
