骶骨骨折三周后仍然疼痛可能是由以下原因引起的：
1. 骨折未完全愈合：骶骨是人体最大的骨头之一，骨折后需要较长时间才能完全愈合。如果骨折未完全愈合，疼痛仍然会持续存在。
2. 炎症反应：骨折后，身体会出现炎症反应，这是身体自我修复的一种机制。然而，如果炎症反应过度或者持续时间过长，就会导致疼痛。
3. 神经损伤：骶骨骨折可能会损伤周围的神经，导致疼痛。这种疼痛可能会持续很长时间，甚至可能会永久存在。
4. 活动不当：如果在骨折未完全愈合的情况下进行过度的活动，会导致疼痛加重。此时应该避免过度活动，以免影响骨折的愈合。
总之，骶骨骨折三周后仍然疼痛可能是由多种原因引起的，需要根据具体情况进行诊断和治疗。建议及时就医，接受专业医生的指导和治疗。