核酸检测咽拭子不能直接查出肝炎。原因如下：
1. 核酸检测是一种检测病毒RNA或DNA的方法，而肝炎病毒的RNA或DNA并不在咽拭子中，因此无法直接检测出肝炎病毒。
2. 肝炎病毒主要通过血液传播，而不是通过口腔或咽喉传播。因此，即使在肝炎病毒感染期间进行咽拭子核酸检测，也不一定能检测出肝炎病毒。
3. 肝炎病毒感染后，肝脏细胞会受到病毒的攻击，导致肝功能异常。因此，如果怀疑肝炎病毒感染，需要进行肝功能检查和肝炎病毒抗体检测等综合检查，才能确定是否感染了肝炎病毒。
综上所述，核酸检测咽拭子不能直接检测出肝炎病毒，需要进行其他检查来确定是否感染了肝炎病毒。