1.消灭传染源 主要是灭鼠。应发动群众，采取综合措施，可用各种捕鼠器，与药物灭鼠相结合。常用药物有磷化锌、安妥和敌鼠等。
2.切断传播途径 铲除杂草，改造环境是最根本的措施，应结合爱国卫生运动、积肥、应用沼气等反复进行，消灭恙螨孳生地。在流行区野外作业时，铲除或焚烧住地周围半径50m内杂草，然后喷洒1%～2%敌敌畏或0.1%马拉硫磷，20～25ml/m2。
3.个人防护 在发病季节避免在草地上坐、卧、晒衣服。预防恙螨幼虫叮咬，在流行区野外工作、生产劳动、军事训练及其他活动时，必须扎紧袖口、领口和裤脚口，并在袖口、领口等处涂上防虫剂，如邻苯二甲酸二甲酯，邻苯二甲酸二苯酯或苯甲酸苄酯等。
目前尚无可供应用的恙虫病疫苗。灭活疫苗效果差，减毒活疫苗未达安全限度，初步研究显示，恙虫病立克次体中分子量为56000的表膜蛋白抗原有较强的免疫原性。编码该蛋白的基因已在大肠杆菌表达成功，能否用其制成疫苗，有待作进一步研究。