1.Ⅰ型
(1)出生后1周内应采取血浆置换疗法，以降低血浆中非结合胆红素的浓度，防止脑组织损伤和胆红素脑病发生;能暂时改善症状。
(2)因肝内无BGT，故对酶诱导剂苯巴比妥无效。
(3)光照疗法：每天须保持15h光疗方能维持血清胆红素浓度在安全范围内，可使黄疸降低，胆红素脑病减少，能暂时改善症状。
(4)用锡原卟啉静脉注射治疗本病，取得满意疗效。锡原卟啉为一种血红素加氧酶的抑制剂，使血红素转变为胆绿素的过程被抑制，减少胆红素的生成。
2.Ⅱ型
(1)因肝内BGT部分缺乏，用胆红素葡萄糖醛酸转移酶的诱导剂苯巴比妥治疗可降低血清胆红素浓度;应坚持长期持续治疗，适当改善非结合型高胆红素血症，从而使部分病儿生存到成年。苯巴比妥(鲁米那)衍生物之类的药物，副作用较小。
(2)光照疗法也有一定效果，利用日光或一定波长的人工灯光照射患儿。光照能改变胆红素的有关异构体，加速非结合胆红素的排出而减轻黄疸。波长430～470nm的光波，可促使间接胆红素氧化，产生无色的水溶性物质，直接分泌入胆汁或从肾脏排出。随着年龄增长光疗的效果越来越差。
(3)应避免使用阿司匹林(乙酰水杨酸)等药物，因该药能同血清非结合胆红素竞争与白蛋白结合，使血清非结合胆红素增加而诱发胆红素脑病。
目前正在实验的新的治疗方法是肝脏移植和肝细胞移植。