蛋黄颜色深的原因是因为其中含有较多的核黄素。核黄素是一种维生素B族的成员，也称为维生素B2。它是人体必需的营养素之一，可以促进细胞的生长和修复，同时也可以帮助身体利用其他营养物质，如蛋白质、碳水化合物和脂肪。
蛋黄中含有较多的核黄素是因为鸡蛋是一种营养丰富的食物，其中不仅含有丰富的蛋白质和脂肪，还含有多种维生素和矿物质。而核黄素是其中的一种维生素，它主要存在于蛋黄中，因此蛋黄的颜色深浅与其中核黄素的含量有关。
此外，鸡蛋的饲料也会影响其中核黄素的含量。如果鸡蛋的饲料中含有较多的核黄素，那么蛋黄中的核黄素含量也会相应增加。因此，饲养环境和饲料的质量也是影响蛋黄颜色和其中营养成分含量的重要因素。